একটি প্রোটিন ডেটা ব্যাঙ্ক (PDB) ফাইল হল একটি ফাইল বিন্যাস যা ত্রিমাত্রিক জৈবিক ডেটা সংরক্ষণ করতে ব্যবহৃত হয়। PDB ফাইলগুলি সাধারণত প্রোটিন, নিউক্লিক অ্যাসিড এবং অন্যান্য জৈব অণুগুলির ডেটা সংরক্ষণ করতে ব্যবহৃত হয়। PDB ফাইলগুলি PyMOL এবং VMD এর মতো সফ্টওয়্যার সহ বিভিন্ন উপায়ে দেখা যেতে পারে। উইন্ডোজ 11-এ, আপনি ফাইল এক্সপ্লোরারে গিয়ে, ভিউ ট্যাবে ক্লিক করে এবং তারপরে লুকানো ফাইল এবং ফোল্ডারগুলি দেখানোর বিকল্পটি নির্বাচন করে একটি PDB ফাইল খুলতে পারেন। একবার আপনি এটি সম্পন্ন করার পরে, আপনি যে PDB ফাইলটি দেখতে চান তা সনাক্ত করতে সক্ষম হবেন। PDB ফাইলগুলি জৈব অণুগুলির সাথে কাজ করা বিজ্ঞানীদের জন্য একটি গুরুত্বপূর্ণ হাতিয়ার, কারণ তারা তিনটি মাত্রায় ডেটা ভিজ্যুয়ালাইজেশন এবং বিশ্লেষণের অনুমতি দেয়। বায়োইনফরমেটিক্স বা কম্পিউটেশনাল বায়োলজির ক্ষেত্রে কাজ করা সকলের জন্য PDB ফাইলগুলি কীভাবে খুলতে হয় এবং দেখতে হয় তা বোঝা একটি গুরুত্বপূর্ণ দক্ষতা।
প্রোটিন ডেটা ব্যাংক (PDB) ফাইল ত্রিমাত্রিক আণবিক ফাইল যা আণবিক কাঠামো সংরক্ষণ করে। এখন, আপনি যদি ভাবছেন কিভাবে পিসিতে এই ধরনের ফাইল খুলবেন, এই পোস্টটি আপনাকে আগ্রহী করবে। এখানে আমরা PDB ফাইল সম্পর্কে বিস্তারিত আলোচনা করব এবং Windows 11/10-এ কীভাবে এই ধরনের ফাইল দেখতে হয়। সুতরাং, আর কোনো ঝামেলা ছাড়াই, আসুন এটি পরীক্ষা করে দেখি!
একটি প্রোটিন ডেটা ব্যাংক (PDB) ফাইল কি?
প্রোটিন ডেটা ব্যাংক (PDB) প্রোটিন, নিউক্লিক অ্যাসিড এবং অন্যান্য বড় অণুর জন্য 3D কাঠামোগত ডেটার একটি ডাটাবেস। থেকে ফাইল জিডিপি ফাইল এক্সটেনশনটি মূলত একটি 3D জৈবিক অণুর গঠন সম্পর্কিত ডেটা ধারণকারী একটি ফাইল। ডেটাতে পারমাণবিক স্থানাঙ্ক, পারমাণবিক কাঠামো, পারমাণবিক সংযোগ, প্রোটিন গঠন, নিউক্লিক অ্যাসিড গঠন এবং আরও অনেক কিছু অন্তর্ভুক্ত রয়েছে। এটিতে পরীক্ষামূলক মেটাডেটাও রয়েছে।
এই ফাইল ফরম্যাটটি প্রোটিন স্থানাঙ্ক বিনিময় করতে বায়োইনফরমেটিক্সে ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়। এটিতে প্রোটিনের গঠন বর্ণনা করে হাজার হাজার লাইন রয়েছে। এখন, আপনি যদি উইন্ডোজ পিসিতে PDB ফাইলগুলি পড়তে বা দেখতে চান তবে আপনাকে একটি ডেডিকেটেড থার্ড পার্টি টুল ব্যবহার করতে হবে কারণ এর জন্য কোনও নেটিভ অ্যাপ নেই। এই পোস্টে, আমরা Windows 11/10 এ PDB ফাইল দেখার বিভিন্ন উপায় নিয়ে আলোচনা করব।
উইন্ডোজ 11-এ প্রোটিন ডেটা ব্যাঙ্ক (পিডিবি) ফাইল কীভাবে দেখবেন?
উইন্ডোজ 11/10 এ প্রোটিন ডেটা ব্যাংক (PDB) ফাইল দেখার দুটি উপায় রয়েছে, যথা:
- PDB ফাইল দেখতে বিনামূল্যে সফ্টওয়্যার ব্যবহার করুন.
- PDB ফাইলগুলি পড়ার জন্য একটি বিনামূল্যের অনলাইন টুল ব্যবহার করে দেখুন।
1] PDB ফাইল দেখতে বিনামূল্যে সফ্টওয়্যার ব্যবহার করুন.
আপনি তৃতীয় পক্ষের উইন্ডোজ সফ্টওয়্যার ব্যবহার করতে পারেন যা আপনাকে PDB ফাইলগুলি খুলতে এবং দেখতে দেয়। উইন্ডোজের জন্য বেশ কয়েকটি বিনামূল্যের ডেস্কটপ অ্যাপ রয়েছে যা আপনি চেষ্টা করতে পারেন। এখানে আপনি ব্যবহার করতে পারেন কিছু ভাল আছে:
- আইকিউমল
- সুইস-পিডিবিভিউয়ার
- কুমোল
- একটি অণু
- রসমল
ক] IKmol
IQmol হল উইন্ডোজ 11/10 এর জন্য একটি ফ্রি এবং ওপেন সোর্স মলিকুলার এডিটর এবং ভিজ্যুয়ালাইজেশন সফটওয়্যার। এটি ব্যবহার করে, আপনি PDB এর পাশাপাশি MOL, SMI, CUBE, XYZ, ইত্যাদির মতো অন্যান্য 3D অণু ফাইলগুলি দেখতে পারেন৷ এই সফ্টওয়্যারটিতে, আপনি সমস্ত গুরুত্বপূর্ণ আণবিক ভিজ্যুয়ালাইজেশন টুলগুলি খুঁজে পেতে পারেন৷ এই সরঞ্জামগুলি মৌলিক থেকে উন্নত পর্যন্ত বিস্তৃত। PDB ফাইল দেখার পাশাপাশি, আপনি আণবিক গঠনও সম্পাদনা করতে পারেন।
এটি আপনাকে একই সময়ে একাধিক PDB ফাইল খুলতে এবং সেগুলিকে একই সময়ে দেখতে দেয়। মডেল ভিউ প্যানেলে, আপনি এক বা একাধিক PDB ফাইলের রেন্ডারিং সক্ষম বা অক্ষম করতে পারেন।
IQmol এর প্রধান বৈশিষ্ট্য:
এই ফ্রি এবং ওপেন সোর্স PDB ফাইল ভিউয়ারের বৈশিষ্ট্যগুলি যা আপনি দেখতে পারেন:
- আপনি জুম ইন/জুম আউট (মাউস হুইল সহ), প্যান, রোটেট, পূর্ণ স্ক্রীন, রিসেট ভিউ, অক্ষ প্রদর্শন ইত্যাদি সহ সমস্ত স্ট্যান্ডার্ড ফাইল ব্রাউজিং সরঞ্জামগুলি খুঁজে পেতে পারেন।
- এটি আপনাকে শেডার, পরিবেষ্টিত আলো, প্রসারণ, কুয়াশার শক্তি, হাইলাইট, শব্দের তীব্রতা, POV-রে পরামিতি ইত্যাদির মতো পরামিতিগুলি সম্পাদনা করে মডেলের চেহারা কাস্টমাইজ করতে দেয়।
- এছাড়াও আপনি পারমাণবিক লেবেল যোগ করতে পারেন যেমন পরমাণুর ভর, আংশিক চার্জ, এনএমআর, স্পিন ঘনত্ব ইত্যাদি।
- এটি আপনাকে আপনার পছন্দ অনুযায়ী ক্যামেরা সেটিংস কাস্টমাইজ করতে দেয়। আপনি ক্যামেরা প্রজেকশন, অবস্থান, ইত্যাদি সামঞ্জস্য করতে পারেন।
- একটি সুবিধাজনক আছে স্বয়ংক্রিয় ঘূর্ণন একটি ফাংশন যা আপনাকে স্বয়ংক্রিয়ভাবে আণবিক মডেল ঘোরাতে দেয়।
- আপনি PNG, PPM, BMP, JPG, PS, EPS ইত্যাদির মতো চিত্র বিন্যাসে বর্তমান প্রোটিন গঠন উপস্থাপনা সংরক্ষণ করতে পারেন।
- এটি আপনাকে 'সেভ অ্যাজ' বৈশিষ্ট্য ব্যবহার করে PDB কে অন্যান্য অণু ফাইলগুলিতে রূপান্তর করতে দেয়। সমর্থিত আউটপুট ফরম্যাট: XYZ, MOL, MOL2, CML, ইত্যাদি।
- আপনি এটি ব্যবহার করতে পারেন হিসাব গণনা করার ফাংশন আণবিক গঠন শক্তি, বাহিনী, PES স্ক্যান, রূপান্তর অবস্থা, রাসায়নিক পরিবর্তন, জ্যামিতি, পচন শক্তি, BSSE সংশোধন, এবং তাই
ফাংশন দেখার পাশাপাশি, আপনি আণবিক নির্মাণ ফাংশনগুলির একটি সেট সহ একটি বিশেষ বিল্ড মেনু পাবেন। এই বৈশিষ্ট্যগুলির মধ্যে রয়েছে নতুন পরমাণু যোগ করা, নতুন অণু সন্নিবেশ করা, গঠন কম করা, আইসোটোপ সেট করা এবং আরও অনেক কিছু।
এটি সত্যিই একটি ভাল আণবিক মডেলিং সফ্টওয়্যার যার সাহায্যে আপনি আপনার পিসিতে প্রোটিন ডেটা ব্যাংক ফাইলগুলি কল্পনা করতে পারেন। ভালো লাগলে ডাউনলোড করুন এখান থেকে .
দেখা: Chem4Word হল Microsoft Word এর জন্য একটি রসায়ন অ্যাড-ইন। .
খ] সুইস-পিডিবিভিউয়ার
Swiss-PdbViewer হল Windows 11/10 এর জন্য একটি বিশেষ বিনামূল্যের PDB ফাইল ভিউয়ার। এটি আপনাকে একই সাথে বেশ কয়েকটি প্রোটিন কাঠামো কল্পনা এবং বিশ্লেষণ করতে দেয়। আপনি PDB ফাইলে থাকা প্রোটিন গঠন, ডিএনএ গঠন ইত্যাদি বিশ্লেষণ করতে পারেন। PDB ফাইল ছাড়াও, এটি আপনাকে MOL এবং MMCIF ফাইলগুলি খুলতে এবং দেখার অনুমতি দেয়।
যখন আপনি একটি PDB ফাইল খুলবেন, একটি 3D ভিউ ইন্টারফেসে একটি কন্ট্রোল প্যানেল উইন্ডো সহ প্রদর্শিত হবে। নিয়ন্ত্রণ প্যানেলে সাধারণ তথ্য, একটি তালিকা এবং একটি ফাইলের শিরোনাম রয়েছে। আপনি সহজেই কাঠামোটি সরাতে পারেন, এটি ঘোরাতে পারেন, জুম ইন/আউট করতে পারেন ইত্যাদি।
এটি আপনাকে আপনার পছন্দ অনুযায়ী ডট সারফেস, বেস, হাইড্রোজেন বন্ড, ফোর্স ভেক্টর এবং আরও অনেক কিছু দেখাতে বা লুকানোর অনুমতি দেয়। আপনি গঠনটি আরও ভালভাবে বিশ্লেষণ করতে বিভিন্ন রঙের স্কিম সহ বিভিন্ন অংশ হাইলাইট করতে পারেন। এছাড়াও, আপনি সলিড 3D-এ রেন্ডার, পিওভি, ডিসপ্লে লেবেল এবং আরও অনেক কিছুর মতো প্রদর্শন বৈশিষ্ট্যগুলি ব্যবহার করতে পারেন৷
ভিজ্যুয়ালাইজেশন টুল ছাড়াও, আপনি অনেক আণবিক মডেলিং বৈশিষ্ট্যও পান। এছাড়াও, এতে শক্তি গণনা, এইচ-বন্ড গণনা, ডোমেন বিশ্লেষণ, ডোমেন সনাক্তকরণ, 3D মোটিফ তৈরি, ক্রিস্টালোগ্রাফিক প্রতিসাম্য বিল্ডিং এবং অন্যান্য সরঞ্জাম রয়েছে।
থেকে ডাউনলোড করতে পারেন অফিসিয়াল সাইট .
পড়ুন: উইন্ডোজ 11/10 এর জন্য সেরা বিনামূল্যে পাওয়ার বিশ্লেষণ সফ্টওয়্যার।
গ] QMol
কুমোল Windows 11/10 এর জন্য আরেকটি বিনামূল্যের PDB ভিউয়ার। এটি একটি ম্যাক্রোমোলিকুলার স্ট্রাকচার ভিজ্যুয়ালাইজেশন টুল যার সাহায্যে আপনি PDB ফাইল দেখতে পারেন। অন্যান্য ফাইলগুলি আপনি খুলতে এবং দেখতে পারেন তা হল DX, MAP, MTZ, CNS ইত্যাদি।
এটি আপনাকে দৃষ্টিকোণ এবং অর্থোগ্রাফিক ভিউয়ের মধ্যে স্যুইচ করতে, মডেলটি ঘোরাতে, জুম ইন/আউট ইত্যাদি করতে দেয়। আপনি POV-Ray এবং এর অ্যানিমেশন রেন্ডারিং পদ্ধতি ব্যবহার করে মডেলটি রেন্ডার করতে পারেন। রেন্ডার করা কাঠামো PNG ফরম্যাটে সংরক্ষণ করা যেতে পারে। একটি পরিমাপ সরঞ্জামও উপলব্ধ যা আপনাকে মডেলটিতে দূরত্ব, কোণ এবং মোচড় পরিমাপ করতে দেয়।
আপনি আরও প্রোটিন গঠন বিশ্লেষণ করতে কিছু অতিরিক্ত সরঞ্জাম খুঁজে পেতে পারেন। এই সরঞ্জাম অন্তর্ভুক্ত মলিকুলার সুপারপজিশন, মোল সারফেস কাটার, মোল সারফেস জেনারেশন, মোল বন্ড এডিটর, মিথস্ক্রিয়া বিশ্লেষণ, মোল মর্ফ অ্যানিমেশন, এবং তাই
PDB ফাইলগুলিতে উপস্থিত প্রোটিন গঠন কল্পনা এবং বিশ্লেষণ করার জন্য এটি একটি ভাল সফ্টওয়্যার।
দেখা: .LIT অপশন # কিভাবে উইন্ডোজে LIT কে EPUB বা MOBI তে রূপান্তর করবেন?
ইয়ানডেক্স মেল পর্যালোচনা
D] অণু
এই তালিকার পরবর্তী পিডিবি ভিউয়ার সফ্টওয়্যার হল মোলেকেল। এটি একটি বরং পুরানো কিন্তু শক্তিশালী আণবিক ভিজ্যুয়ালাইজেশন সফ্টওয়্যার যা আপনাকে PDB ফাইলগুলি খুলতে এবং দেখতে দেয়। আপনি অনেক আণবিক ভিজ্যুয়ালাইজেশন এবং বিশ্লেষণ সরঞ্জাম খুঁজে পেতে পারেন যা আপনাকে প্রোটিন গঠন বিশ্লেষণ করতে দেয়।
এটি আপনাকে অণু, পরমাণু, বন্ধন, অবশিষ্টাংশ ইত্যাদির প্রদর্শন কাস্টমাইজ করার অনুমতি দেয়। আপনি তাদের প্রতিটির জন্য বিভিন্ন ধরনের প্রদর্শন চয়ন করতে পারেন, যেমন বল ও স্টিক, সিপিকে, গোলার্ধ, সোস্ফিয়ার, পূর্ণ গোলক, সিলিন্ডার, সোসিলিন্ডার, সেমিসিলিন্ডার, ওয়্যার, স্টিক, লিনিয়ার টেপ ইত্যাদি। এছাড়াও, আপনি 3D ভিউ এর বৈশিষ্ট্যগুলি সামঞ্জস্য করতে পারেন, বাউন্ডিং বাক্সগুলি দেখান/লুকাতে পারেন, শেডার ব্যবহার করতে পারেন, ইত্যাদি। এটি আপনাকে পৃষ্ঠের ইলেক্ট্রন ঘনত্ব পরিবর্তন করে PDB ফাইল দেখতে দেয়। গঠন এবং দ্রাবক জন্য উপলব্ধ একটি পৃষ্ঠ যোগ, গঠন.
তুমি খুজেঁ পাবে অ্যানিমেশন এটিতে একটি ফাংশন অণুর কাঠামোর অ্যানিমেশন খেলতে। এটিতে উপযুক্ত সরঞ্জাম সহ একটি বিশেষ 'বিশ্লেষণ' মেনু রয়েছে। বিশ্লেষণ সরঞ্জাম ব্যবহার করে, আপনি একটি কাঠামোর জন্য গ্রিড ডেটা, ঘূর্ণন ঘনত্ব, আণবিক ইলেক্ট্রোস্ট্যাটিক সম্ভাব্যতা, নির্গমন বর্ণালী, দূরত্ব, কোণ এবং আরও অনেক কিছু নির্ধারণ করতে পারেন।
এটি আপনাকে PDB ফাইলগুলিকে বিভিন্ন ফাইল ফর্ম্যাটে রূপান্তর করতে দেয়। এই ফর্ম্যাটগুলির মধ্যে PDF, PS, EPS এবং চিত্র অন্তর্ভুক্ত রয়েছে। ভালো লাগলে পেতে পারেন এখানে .
পড়ুন: সম্পূর্ণ অ্যানাটমি অ্যাপটি উইন্ডোজের জন্য একটি যোগ্য ডাউনলোড। .
ঙ] রসমল
আপনি Windows 11/10 এ PDB ফাইল দেখতে RasMol ব্যবহার করতে পারেন। এটি একটি বিনামূল্যের এবং ওপেন সোর্স সফ্টওয়্যার যা আপনাকে আণবিক গঠনগুলি কল্পনা এবং বিশ্লেষণ করতে দেয়৷ এটি এমওএল, এক্সওয়াইজেড, সিআইএফ, এমওপিএসি, ইত্যাদির মতো অন্যান্য ফাইলগুলি খোলা এবং দেখতে সমর্থন করে।
এটি আপনাকে কাঠামোটিকে একটি ফ্রেম, ওয়ার্প, রড, ফিতা, স্ট্র্যান্ড ইত্যাদি হিসাবে দেখতে দেয়। এছাড়াও আপনি বিভিন্ন রং দিয়ে কাঠামোর বিভিন্ন অংশ হাইলাইট করতে পারেন। এটি আপনাকে আপনার পছন্দ অনুযায়ী হাইড্রোজেন পরমাণু, হেটেরোঅটম, ছায়া, লেবেল ইত্যাদি দেখাতে বা লুকানোর অনুমতি দেয়। আপনি একটি কাঠামোতে দূরত্ব, টর্শন, কোণ এবং অন্যান্য মানগুলিও পরিমাপ করতে পারেন।
এই সফ্টওয়্যার উপলব্ধ এখানে .
দেখা: উইন্ডোজের জন্য সেরা ফ্রি 3D হিউম্যান অ্যানাটমি সফটওয়্যার।
2] PDB ফাইলগুলি পড়ার জন্য একটি বিনামূল্যের অনলাইন টুল ব্যবহার করে দেখুন।
আপনি PDB ফাইলগুলি খুলতে এবং দেখতে একটি বিনামূল্যের অনলাইন টুল ব্যবহার করতে পারেন। আপনাকে যা করতে হবে তা হল একটি ওয়েব ব্রাউজারে ওয়েবসাইটটি খুলুন এবং এটি দেখতে PDB ফাইল ডাউনলোড করুন। এখানে কিছু ভাল বিনামূল্যের অনলাইন PDB দর্শক আপনি চেষ্টা করতে পারেন:
- আরসিএসবি পিডিবি
- মলসফট
ক] আরসিএসবি পিডিবি
ব্যতিক্রম অজানা সফ্টওয়্যার ব্যতিক্রম
আপনি প্রোটিন ডেটা ব্যাঙ্ক ফাইলগুলি কল্পনা করতে RCSB PDB নামে এই বিনামূল্যের অনলাইন টুলটি ব্যবহার করতে পারেন। এটি আপনাকে একটি PDB ফাইল আমদানি করতে এবং তারপরে এর আণবিক গঠনটি কল্পনা ও বিশ্লেষণ করতে দেয়।
আপনি জুম, ঘূর্ণন, উন্নত পোর্ট ভিউ টগল, ক্যামেরা রিসেট, নির্বাচন মোড টগল ইত্যাদির মতো কিছু মৌলিক ভিজ্যুয়ালাইজেশন বৈশিষ্ট্যগুলি খুঁজে পেতে পারেন৷ এটি আপনাকে ক্যামেরা মোড (দৃষ্টিকোণ বা অর্থোগ্রাফিক), পটভূমির রঙের মতো কিছু সেটিংস বা নিয়ন্ত্রণ বিকল্পগুলিকে সামঞ্জস্য করতে দেয়৷ /বন্ধ। বাধা নিষ্ক্রিয় করুন, কুয়াশা, ক্লিপিং, অবস্থান, ইত্যাদি সক্ষম/অক্ষম করুন।
এর সাথে আসে অ্যানিমেট ফাংশন এটি ব্যবহার করে, আপনি স্বয়ংক্রিয়ভাবে প্রোটিন গঠন ঘোরাতে পারেন। এটি দিয়ে, আপনি ঘূর্ণন গতি এবং কোণ সামঞ্জস্য করতে পারেন। আপনি একটি উত্সর্গীকৃত পেতে মাপা এর মধ্যে টুল। এই টুলটি ব্যবহার করে, আপনি দূরত্ব, অভিযোজন, কোণ এবং আরও অনেক কিছুর মতো একাধিক মান খুঁজে পেতে পারেন।
এই বৈশিষ্ট্যগুলি ছাড়াও, আরও বেশ কিছু সহজ টুল উপলব্ধ রয়েছে: কাঠামোর মোটিফ অনুসন্ধান, উপাদান যোগ করা, অ্যানিমেশন রপ্তানি, জ্যামিতি রপ্তানি (STL, OBJ, ইত্যাদি) এবং মডেল রপ্তানি।
সব মিলিয়ে, এটি ভিজ্যুয়ালাইজেশন টুলের একটি দুর্দান্ত সেট সহ একটি সত্যিই ভাল বিনামূল্যের অনলাইন পিডিবি ভিউয়ার। আপনি চেষ্টা করতে পারেন এখানে .
খ] মলসফট
Molsoft হল আরেকটি অনলাইন টুল যা PDB কাঠামো কল্পনা করতে ব্যবহার করা যেতে পারে। এটি মৌলিক বৈশিষ্ট্য সহ একটি সাধারণ PDB ফাইল ভিউয়ার। প্রথমত, এটি খুলুন ওয়েব সাইট এবং তিন-লেন মেনু বিকল্পে ক্লিক করুন। এর পরে, একটি স্থানীয়ভাবে সংরক্ষিত PDB ফাইল আমদানি করতে বা আপনার Google ড্রাইভ থেকে একটি ফাইল আপলোড করতে 'ওপেন' বিকল্পটি নির্বাচন করুন৷ আপনি যখন একটি ফাইল নির্বাচন করেন, এটি আপনাকে দর্শকের আণবিক গঠন দেখাবে।
আপনি কাঠামোটি কল্পনা করতে বিভিন্ন ভিউ মোড ব্যবহার করতে পারেন। এই দৃশ্যগুলির মধ্যে রয়েছে ওয়্যারফ্রেম, ক্রিয়েটাইন ফসফোকিনেস (CPK), বল এবং রড, ফিতা এবং আরও অনেক কিছু। আপনার প্রয়োজনীয়তা অনুসারে আপনি সহজেই এই ভিউ মোডগুলির মধ্যে স্যুইচ করতে পারেন। উপরন্তু, এটি আপনাকে পরমাণু লেবেল, অবশিষ্টাংশ লেবেল, হাইড্রোজেন বন্ড এবং সাইটগুলিকে গঠনের আরও ভাল বোঝার জন্য সক্ষম বা নিষ্ক্রিয় করতে দেয়।
এটি পরিমাপের সরঞ্জামও সরবরাহ করে। আপনি মডেলে দূরত্ব, সমতল কোণ এবং মোচড়ের কোণ পরিমাপ করতে পারেন। উপরন্তু, ফাংশন দ্বারা একটি সহজ রঙ পাওয়া যায়, যা আপনাকে পরমাণুর ধরন, চেইন, প্রান্তিককরণ, গৌণ কাঠামো ইত্যাদি দ্বারা কাঠামোকে রঙ করতে দেয়।
এটি আরেকটি ভাল অনলাইন পিডিবি ফাইল ভিউয়ার যা আপনি বিনামূল্যে চেষ্টা করতে পারেন।
প্রোটিন ডেটা ব্যাংক থেকে একটি PDB ফাইল কিভাবে ডাউনলোড করবেন?
প্রোটিন ডেটা ব্যাঙ্ক থেকে একটি পিডিবি ফাইল ডাউনলোড করতে, আপনি প্রোটিন ডেটা ব্যাঙ্কের ওয়েবসাইটে যেতে পারেন, প্রোটিন বা ম্যাক্রোমোলিকুলের নাম লিখুন এবং অনুসন্ধান করুন, যেমন মানব হিমোগ্লোবিন, কাইটিনেজ ইত্যাদি। তারপর অনুসন্ধান ফলাফল থেকে ফাইলটি নির্বাচন করুন এবং পিডিবি ফাইল ডাউনলোড করতে ডাউনলোড বিকল্পটি ব্যবহার করুন। এর মত সহজ.
কিভাবে PDB কাঠামো দেখতে?
PDB এর আণবিক কাঠামো একটি ডেডিকেটেড অনলাইন টুল বা সফ্টওয়্যার অ্যাপ্লিকেশন ব্যবহার করে দেখা যেতে পারে। আপনি আপনার পিসিতে PDB কাঠামো কল্পনা ও বিশ্লেষণ করতে IQmol, Swiss-PdbViewer এবং CueMol-এর মতো বিনামূল্যের সফ্টওয়্যার ব্যবহার করে দেখতে পারেন। আপনি যদি একটি অনলাইন টুল ব্যবহার করতে পছন্দ করেন তবে অনেকগুলি বিকল্প রয়েছে। উদাহরণস্বরূপ, RCSB PDB এবং Molsoft এর মতো ওয়েব পরিষেবাগুলি ব্যবহার করে দেখুন৷ এগুলি বিনামূল্যের অনলাইন পিডিবি ফাইল দর্শক যা উন্নত আণবিক ভিজ্যুয়ালাইজেশন এবং বিশ্লেষণ সরঞ্জাম সরবরাহ করে।
কিভাবে PDB ফাইল PDF এ রূপান্তর করবেন?
PDB ফাইলকে PDF এ রূপান্তর করতে, আপনি Molekel নামক এই বিনামূল্যের ডেস্কটপ অ্যাপ্লিকেশনটি ব্যবহার করতে পারেন। এটি একটি বিশেষ 'Save to PDF' বিকল্প প্রদান করে যা আপনাকে PDB ফাইলটিকে PDF ফরম্যাটে রূপান্তর করতে দেয়। আপনি PDB ফাইলটি খুলতে পারেন এবং তারপর PDB-এ PDF রূপান্তর করতে 'ফাইল' > 'পিডিএফ-এ সংরক্ষণ করুন'-এ ক্লিক করতে পারেন। আমরা এই পোস্টে এই সফ্টওয়্যারটি বিস্তারিতভাবে আলোচনা করেছি, উপরে এটি পরীক্ষা করে দেখুন।
এখানেই শেষ.
এখন পড়ুন: উইন্ডোজের জন্য সেরা ফ্রি মলিকুলার মডেলিং সফটওয়্যার।
